Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF479Q96JC4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF479Q96JC4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF479Q96JC4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF479Q96JC4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF479Q96JC4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF479Q96JC4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF479Q96JC4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF479Q96JC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF479Q96JC4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF479Q96JC4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF479Q96JC4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF479Q96JC4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF479Q96JC4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms