Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIC2Q96JB3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIC2Q96JB3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIC2Q96JB3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HIC2Q96JB3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIC2Q96JB3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIC2Q96JB3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIC2Q96JB3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIC2Q96JB3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIC2Q96JB3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms