Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms