Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAMBPL1Q96FJ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAMBPL1Q96FJ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAMBPL1Q96FJ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAMBPL1Q96FJ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAMBPL1Q96FJ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAMBPL1Q96FJ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
STAMBPL1Q96FJ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPL1Q96FJ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms