Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAMBPL1Q96FJ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAMBPL1Q96FJ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STAMBPL1Q96FJ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
STAMBPL1Q96FJ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
STAMBPL1Q96FJ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
STAMBPL1Q96FJ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
STAMBPL1Q96FJ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
STAMBPL1Q96FJ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
STAMBPL1Q96FJ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
STAMBPL1Q96FJ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
STAMBPL1Q96FJ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STAMBPL1Q96FJ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
STAMBPL1Q96FJ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
STAMBPL1Q96FJ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
STAMBPL1Q96FJ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
STAMBPL1Q96FJ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
STAMBPL1Q96FJ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
STAMBPL1Q96FJ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
STAMBPL1Q96FJ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
STAMBPL1Q96FJ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STAMBPL1Q96FJ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
STAMBPL1Q96FJ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
STAMBPL1Q96FJ0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
STAMBPL1Q96FJ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
STAMBPL1Q96FJ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
STAMBPL1Q96FJ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
STAMBPL1Q96FJ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
STAMBPL1Q96FJ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
STAMBPL1Q96FJ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
STAMBPL1Q96FJ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
STAMBPL1Q96FJ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
STAMBPL1Q96FJ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STAMBPL1Q96FJ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STAMBPL1Q96FJ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
STAMBPL1Q96FJ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
STAMBPL1Q96FJ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
STAMBPL1Q96FJ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
STAMBPL1Q96FJ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STAMBPL1Q96FJ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STAMBPL1Q96FJ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STAMBPL1Q96FJ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STAMBPL1Q96FJ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STAMBPL1Q96FJ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
STAMBPL1Q96FJ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STAMBPL1Q96FJ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
STAMBPL1Q96FJ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
STAMBPL1Q96FJ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
STAMBPL1Q96FJ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
STAMBPL1Q96FJ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
STAMBPL1Q96FJ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STAMBPL1Q96FJ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STAMBPL1Q96FJ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STAMBPL1Q96FJ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STAMBPL1Q96FJ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STAMBPL1Q96FJ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STAMBPL1Q96FJ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STAMBPL1Q96FJ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STAMBPL1Q96FJ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STAMBPL1Q96FJ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STAMBPL1Q96FJ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
STAMBPL1Q96FJ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STAMBPL1Q96FJ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STAMBPL1Q96FJ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STAMBPL1Q96FJ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STAMBPL1Q96FJ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STAMBPL1Q96FJ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STAMBPL1Q96FJ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STAMBPL1Q96FJ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STAMBPL1Q96FJ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STAMBPL1Q96FJ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STAMBPL1Q96FJ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STAMBPL1Q96FJ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAMBPL1Q96FJ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAMBPL1Q96FJ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAMBPL1Q96FJ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAMBPL1Q96FJ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
STAMBPL1Q96FJ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STAMBPL1Q96FJ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAMBPL1Q96FJ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STAMBPL1Q96FJ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms