Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO17Q96EF6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO17Q96EF6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO17Q96EF6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO17Q96EF6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO17Q96EF6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO17Q96EF6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO17Q96EF6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO17Q96EF6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms