Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP3Q96DZ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP3Q96DZ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP3Q96DZ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP3Q96DZ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP3Q96DZ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP3Q96DZ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP3Q96DZ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP3Q96DZ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms