Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI2Q96DH6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSI2Q96DH6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSI2Q96DH6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI2Q96DH6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSI2Q96DH6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSI2Q96DH6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSI2Q96DH6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MSI2Q96DH6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms