Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF428Q96B54 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF428Q96B54 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF428Q96B54 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF428Q96B54 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF428Q96B54 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF428Q96B54 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF428Q96B54 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF428Q96B54 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF428Q96B54 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF428Q96B54 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF428Q96B54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF428Q96B54 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF428Q96B54 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF428Q96B54 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF428Q96B54 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF428Q96B54 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF428Q96B54 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZNF428Q96B54 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF428Q96B54 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZNF428Q96B54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF428Q96B54 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZNF428Q96B54 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZNF428Q96B54 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZNF428Q96B54 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF428Q96B54 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF428Q96B54 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZNF428Q96B54 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF428Q96B54 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF428Q96B54 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF428Q96B54 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms