Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL26A1Q96A83 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL26A1Q96A83 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL26A1Q96A83 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL26A1Q96A83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL26A1Q96A83 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL26A1Q96A83 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL26A1Q96A83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms