Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFKQ969G6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFKQ969G6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFKQ969G6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFKQ969G6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFKQ969G6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFKQ969G6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFKQ969G6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFKQ969G6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFKQ969G6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFKQ969G6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RFKQ969G6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFKQ969G6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFKQ969G6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFKQ969G6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFKQ969G6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFKQ969G6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFKQ969G6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFKQ969G6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RFKQ969G6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFKQ969G6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFKQ969G6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms