Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CELF1Q92879 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CELF1Q92879 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CELF1Q92879 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CELF1Q92879 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CELF1Q92879 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CELF1Q92879 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CELF1Q92879 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CELF1Q92879 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CELF1Q92879 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CELF1Q92879 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CELF1Q92879 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CELF1Q92879 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CELF1Q92879 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CELF1Q92879 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CELF1Q92879 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CELF1Q92879 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CELF1Q92879 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CELF1Q92879 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CELF1Q92879 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CELF1Q92879 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CELF1Q92879 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CELF1Q92879 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CELF1Q92879 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CELF1Q92879 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CELF1Q92879 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CELF1Q92879 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms