Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3AQ92664 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3AQ92664 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3AQ92664 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3AQ92664 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3AQ92664 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3AQ92664 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3AQ92664 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3AQ92664 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3AQ92664 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3AQ92664 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3AQ92664 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3AQ92664 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3AQ92664 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms