Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC9Q92623 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC9Q92623 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC9Q92623 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC9Q92623 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC9Q92623 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC9Q92623 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC9Q92623 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC9Q92623 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms