Protein–RNA interactions for Protein: Q92583

CCL17, C-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL17Q92583 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms