Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF3Q92576 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF3Q92576 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF3Q92576 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF3Q92576 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF3Q92576 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF3Q92576 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF3Q92576 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms