Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCSTNQ92542 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCSTNQ92542 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCSTNQ92542 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCSTNQ92542 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCSTNQ92542 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCSTNQ92542 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NCSTNQ92542 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCSTNQ92542 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms