Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX1Q92499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX1Q92499 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX1Q92499 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX1Q92499 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX1Q92499 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX1Q92499 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX1Q92499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX1Q92499 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX1Q92499 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX1Q92499 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX1Q92499 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX1Q92499 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX1Q92499 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX1Q92499 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX1Q92499 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX1Q92499 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX1Q92499 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX1Q92499 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX1Q92499 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX1Q92499 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX1Q92499 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX1Q92499 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX1Q92499 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX1Q92499 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX1Q92499 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX1Q92499 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX1Q92499 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX1Q92499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX1Q92499 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX1Q92499 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX1Q92499 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX1Q92499 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms