Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWV3

RTN4IP1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4IP1Q8WWV3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4IP1Q8WWV3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4IP1Q8WWV3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN4IP1Q8WWV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN4IP1Q8WWV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4IP1Q8WWV3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4IP1Q8WWV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4IP1Q8WWV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4IP1Q8WWV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms