Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSMEM1Q8WWF3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSMEM1Q8WWF3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSMEM1Q8WWF3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSMEM1Q8WWF3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSMEM1Q8WWF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSMEM1Q8WWF3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SSMEM1Q8WWF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSMEM1Q8WWF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms