Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMBR1Q8WVP7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMBR1Q8WVP7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMBR1Q8WVP7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LMBR1Q8WVP7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMBR1Q8WVP7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
LMBR1Q8WVP7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMBR1Q8WVP7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMBR1Q8WVP7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMBR1Q8WVP7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMBR1Q8WVP7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMBR1Q8WVP7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMBR1Q8WVP7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LMBR1Q8WVP7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms