Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM58Q8NG06 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM58Q8NG06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM58Q8NG06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM58Q8NG06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM58Q8NG06 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM58Q8NG06 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM58Q8NG06 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM58Q8NG06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM58Q8NG06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM58Q8NG06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM58Q8NG06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM58Q8NG06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM58Q8NG06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM58Q8NG06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM58Q8NG06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM58Q8NG06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM58Q8NG06 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM58Q8NG06 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms