Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP11CQ8NB49 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP11CQ8NB49 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP11CQ8NB49 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP11CQ8NB49 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP11CQ8NB49 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP11CQ8NB49 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP11CQ8NB49 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP11CQ8NB49 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP11CQ8NB49 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11CQ8NB49 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP11CQ8NB49 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP11CQ8NB49 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP11CQ8NB49 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP11CQ8NB49 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP11CQ8NB49 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP11CQ8NB49 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms