Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC63Q8NA47 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC63Q8NA47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC63Q8NA47 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC63Q8NA47 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC63Q8NA47 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC63Q8NA47 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC63Q8NA47 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC63Q8NA47 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC63Q8NA47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC63Q8NA47 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC63Q8NA47 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC63Q8NA47 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC63Q8NA47 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC63Q8NA47 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC63Q8NA47 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC63Q8NA47 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms