Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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