Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO5AQ8N6Q1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO5AQ8N6Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO5AQ8N6Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO5AQ8N6Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO5AQ8N6Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO5AQ8N6Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO5AQ8N6Q1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms