Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP4X1Q8N118 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP4X1Q8N118 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP4X1Q8N118 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4X1Q8N118 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4X1Q8N118 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP4X1Q8N118 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP4X1Q8N118 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP4X1Q8N118 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP4X1Q8N118 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP4X1Q8N118 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP4X1Q8N118 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP4X1Q8N118 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP4X1Q8N118 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP4X1Q8N118 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP4X1Q8N118 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP4X1Q8N118 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP4X1Q8N118 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP4X1Q8N118 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4X1Q8N118 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4X1Q8N118 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms