Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA2D3Q8IZS8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D3Q8IZS8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D3Q8IZS8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNA2D3Q8IZS8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D3Q8IZS8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D3Q8IZS8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D3Q8IZS8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D3Q8IZS8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms