Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CACNA2D3Q8IZS8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CACNA2D3Q8IZS8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CACNA2D3Q8IZS8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CACNA2D3Q8IZS8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CACNA2D3Q8IZS8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
CACNA2D3Q8IZS8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CACNA2D3Q8IZS8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CACNA2D3Q8IZS8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CACNA2D3Q8IZS8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNA2D3Q8IZS8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CACNA2D3Q8IZS8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNA2D3Q8IZS8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CACNA2D3Q8IZS8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CACNA2D3Q8IZS8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CACNA2D3Q8IZS8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CACNA2D3Q8IZS8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CACNA2D3Q8IZS8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CACNA2D3Q8IZS8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNA2D3Q8IZS8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CACNA2D3Q8IZS8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CACNA2D3Q8IZS8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNA2D3Q8IZS8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CACNA2D3Q8IZS8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA2D3Q8IZS8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA2D3Q8IZS8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CACNA2D3Q8IZS8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNA2D3Q8IZS8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CACNA2D3Q8IZS8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNA2D3Q8IZS8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNA2D3Q8IZS8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNA2D3Q8IZS8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA2D3Q8IZS8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA2D3Q8IZS8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA2D3Q8IZS8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNA2D3Q8IZS8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CACNA2D3Q8IZS8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CACNA2D3Q8IZS8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CACNA2D3Q8IZS8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNA2D3Q8IZS8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA2D3Q8IZS8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA2D3Q8IZS8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA2D3Q8IZS8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA2D3Q8IZS8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNA2D3Q8IZS8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CACNA2D3Q8IZS8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CACNA2D3Q8IZS8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA2D3Q8IZS8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA2D3Q8IZS8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA2D3Q8IZS8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA2D3Q8IZS8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CACNA2D3Q8IZS8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CACNA2D3Q8IZS8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CACNA2D3Q8IZS8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CACNA2D3Q8IZS8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CACNA2D3Q8IZS8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CACNA2D3Q8IZS8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CACNA2D3Q8IZS8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNA2D3Q8IZS8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA2D3Q8IZS8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA2D3Q8IZS8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNA2D3Q8IZS8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNA2D3Q8IZS8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNA2D3Q8IZS8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA2D3Q8IZS8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNA2D3Q8IZS8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA2D3Q8IZS8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA2D3Q8IZS8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNA2D3Q8IZS8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA2D3Q8IZS8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CACNA2D3Q8IZS8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNA2D3Q8IZS8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNA2D3Q8IZS8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA2D3Q8IZS8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA2D3Q8IZS8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA2D3Q8IZS8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA2D3Q8IZS8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA2D3Q8IZS8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNA2D3Q8IZS8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNA2D3Q8IZS8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNA2D3Q8IZS8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CACNA2D3Q8IZS8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA2D3Q8IZS8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA2D3Q8IZS8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA2D3Q8IZS8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA2D3Q8IZS8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA2D3Q8IZS8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CACNA2D3Q8IZS8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CACNA2D3Q8IZS8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA2D3Q8IZS8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA2D3Q8IZS8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA2D3Q8IZS8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms