Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.068e-7■■■■■ 43.1
PHF6Q8IWS0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.898e-7■■■■■ 43.1
PHF6Q8IWS0 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 520.42■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 43.1
PHF6Q8IWS0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 43.1
PHF6Q8IWS0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 43.1
PHF6Q8IWS0 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 213.12□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 43.1
PHF6Q8IWS0 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 43.1
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 513.46□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 42.4
PHF6Q8IWS0 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 521.11■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 42.3
PHF6Q8IWS0 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 519.34■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 42.3
PHF6Q8IWS0 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 221.42■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 42.1
PHF6Q8IWS0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 41.8
PHF6Q8IWS0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 41.8
PHF6Q8IWS0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 41.8
PHF6Q8IWS0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 41.8
PHF6Q8IWS0 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 311.51□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 41.2
PHF6Q8IWS0 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.26■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 41.1
PHF6Q8IWS0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 41.1
PHF6Q8IWS0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.239e-7■■■■■ 41.1
PHF6Q8IWS0 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.5□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 41.1
PHF6Q8IWS0 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.529e-7■■■■■ 41.1
PHF6Q8IWS0 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 41.1
PHF6Q8IWS0 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 41
PHF6Q8IWS0 LZTS2-205ENST00000454422 804 ntTSL 235.55■■■■□ 3.284e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NDST2-203ENST00000398701 545 ntTSL 228.75■■■□□ 2.194e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.54e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-216ENST00000520893 943 ntTSL 523.08■■□□□ 1.294e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FSCN1-204ENST00000447103 713 ntTSL 422.89■■□□□ 1.254e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 UBE2E1-208ENST00000481622 432 ntTSL 522.64■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FSCN1-203ENST00000444748 580 ntTSL 322.43■■□□□ 1.184e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 222.11■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-208ENST00000517426 1574 ntTSL 521.77■■□□□ 1.084e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)21.62■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 321.56■■□□□ 1.044e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FSCN1-202ENST00000405801 550 ntTSL 421.48■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 221.36■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 LZTS2-204ENST00000429732 701 ntTSL 521■□□□□ 0.954e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FAM60A-208ENST00000543615 669 ntTSL 520.7■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-213ENST00000519758 991 ntTSL 319.78■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 40.8
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PHF6Q8IWS0 CDK16-217ENST00000522234 1679 ntTSL 219.69■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PARVB-202ENST00000402876 560 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 318.77■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 318.59■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 318.59■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPARGC1B-206ENST00000461780 566 ntTSL 418.54■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 UBE2E1-209ENST00000484048 786 ntTSL 318.52■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 518.51■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 UBE2E1-211ENST00000495141 582 ntTSL 218.5■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 418.46■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 IL4I1-206ENST00000596022 747 ntTSL 218.36■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 IL4I1-208ENST00000601717 2261 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 317.88■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 SCRIB-205ENST00000526832 2189 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 317.68■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 40.8
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PHF6Q8IWS0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-219ENST00000599830 588 ntTSL 417.45■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-215ENST00000520295 573 ntTSL 417.43■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 517.03■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 SCRIB-208ENST00000546337 516 ntTSL 317.01■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-204ENST00000594673 564 ntTSL 516.98■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-219ENST00000581770 447 ntTSL 216.81■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-209ENST00000517479 520 ntTSL 416.53■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 LZTS2-206ENST00000481129 745 ntTSL 316.26■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-206ENST00000595463 563 ntTSL 416.22■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 315.72■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-216ENST00000599560 562 ntTSL 215.62■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-220ENST00000600583 782 ntTSL 415.48■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-223ENST00000601665 531 ntTSL 515.4■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 IL4I1-207ENST00000597295 651 ntTSL 315.28■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FAM60A-204ENST00000536836 1734 ntTSL 215.26■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -04e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-218ENST00000522883 601 ntTSL 414.98□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 314.63□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-210ENST00000517997 562 ntTSL 414.45□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 40.8
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