Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRSK2Q8IWQ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRSK2Q8IWQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRSK2Q8IWQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BRSK2Q8IWQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRSK2Q8IWQ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRSK2Q8IWQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRSK2Q8IWQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRSK2Q8IWQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRSK2Q8IWQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRSK2Q8IWQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRSK2Q8IWQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRSK2Q8IWQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRSK2Q8IWQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRSK2Q8IWQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRSK2Q8IWQ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRSK2Q8IWQ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRSK2Q8IWQ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRSK2Q8IWQ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRSK2Q8IWQ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRSK2Q8IWQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRSK2Q8IWQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRSK2Q8IWQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRSK2Q8IWQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRSK2Q8IWQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRSK2Q8IWQ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRSK2Q8IWQ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRSK2Q8IWQ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms