Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APRG1Q8IVJ8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APRG1Q8IVJ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APRG1Q8IVJ8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APRG1Q8IVJ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APRG1Q8IVJ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APRG1Q8IVJ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APRG1Q8IVJ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms