Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y25

ZNF354C, Zinc finger protein 354C, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354CQ86Y25 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF354CQ86Y25 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF354CQ86Y25 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF354CQ86Y25 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF354CQ86Y25 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF354CQ86Y25 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF354CQ86Y25 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF354CQ86Y25 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF354CQ86Y25 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF354CQ86Y25 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms