Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI3

NLRC5, Protein NLRC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC5Q86WI3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRC5Q86WI3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRC5Q86WI3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRC5Q86WI3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRC5Q86WI3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRC5Q86WI3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRC5Q86WI3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRC5Q86WI3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRC5Q86WI3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRC5Q86WI3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRC5Q86WI3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRC5Q86WI3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRC5Q86WI3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRC5Q86WI3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRC5Q86WI3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRC5Q86WI3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRC5Q86WI3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRC5Q86WI3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRC5Q86WI3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRC5Q86WI3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRC5Q86WI3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRC5Q86WI3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRC5Q86WI3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRC5Q86WI3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.5 ms