Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms