Protein–RNA interactions for Protein: Q86UN3

RTN4RL2, Reticulon-4 receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RL2Q86UN3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RL2Q86UN3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN4RL2Q86UN3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN4RL2Q86UN3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4RL2Q86UN3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4RL2Q86UN3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4RL2Q86UN3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN4RL2Q86UN3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms