Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PBRM1Q86U86 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
PBRM1Q86U86 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
PBRM1Q86U86 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
PBRM1Q86U86 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
PBRM1Q86U86 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
PBRM1Q86U86 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.96■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
PBRM1Q86U86 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
PBRM1Q86U86 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC45.93■■■■■ 4.94
PBRM1Q86U86 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
PBRM1Q86U86 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
PBRM1Q86U86 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
PBRM1Q86U86 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
PBRM1Q86U86 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
PBRM1Q86U86 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
PBRM1Q86U86 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
PBRM1Q86U86 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
PBRM1Q86U86 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
PBRM1Q86U86 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
PBRM1Q86U86 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
PBRM1Q86U86 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
PBRM1Q86U86 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
PBRM1Q86U86 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
PBRM1Q86U86 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
PBRM1Q86U86 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
PBRM1Q86U86 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
PBRM1Q86U86 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
PBRM1Q86U86 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
PBRM1Q86U86 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
PBRM1Q86U86 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.89
PBRM1Q86U86 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
PBRM1Q86U86 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
PBRM1Q86U86 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
PBRM1Q86U86 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
PBRM1Q86U86 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
PBRM1Q86U86 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
PBRM1Q86U86 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
PBRM1Q86U86 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.88
PBRM1Q86U86 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.5■■■■■ 4.88
PBRM1Q86U86 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.5■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
PBRM1Q86U86 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
PBRM1Q86U86 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.34■■■■■ 4.85
PBRM1Q86U86 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
PBRM1Q86U86 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
PBRM1Q86U86 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.33■■■■■ 4.85
PBRM1Q86U86 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
PBRM1Q86U86 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
PBRM1Q86U86 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
PBRM1Q86U86 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
PBRM1Q86U86 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
PBRM1Q86U86 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
PBRM1Q86U86 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
PBRM1Q86U86 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
PBRM1Q86U86 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
PBRM1Q86U86 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.18■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms