Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT9Q86SS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT9Q86SS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT9Q86SS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT9Q86SS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT9Q86SS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT9Q86SS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT9Q86SS6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT9Q86SS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms