Protein–RNA interactions for Protein: Q86SG4

HMGN2P46, Putative Dresden prostate carcinoma protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P46Q86SG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGN2P46Q86SG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGN2P46Q86SG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGN2P46Q86SG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGN2P46Q86SG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGN2P46Q86SG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGN2P46Q86SG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGN2P46Q86SG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGN2P46Q86SG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGN2P46Q86SG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGN2P46Q86SG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGN2P46Q86SG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN2P46Q86SG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGN2P46Q86SG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGN2P46Q86SG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGN2P46Q86SG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGN2P46Q86SG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGN2P46Q86SG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms