Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 53.69□□□□□ -1.825e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 ADAM10-202ENST00000396136 2418 ntTSL 1 (best)3.54□□□□□ -1.845e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 KIAA1551-202ENST00000381054 2326 ntTSL 53.54□□□□□ -1.845e-8■■■■■ 41.4
LARP4Q71RC2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 41.2
LARP4Q71RC2 AP1M2-210ENST00000592285 336 ntTSL 314.19□□□□□ -0.143e-11■■■■■ 40.7
LARP4Q71RC2 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)22.32■■□□□ 1.167e-7■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.347e-7■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.441e-12■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 NDUFB6-201ENST00000350021 666 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-12■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.721e-11■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.691e-11■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.691e-11■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-11■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 DDT-205ENST00000428792 333 ntTSL 27.36□□□□□ -1.231e-10■■■■■ 40.6
LARP4Q71RC2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.266e-10■■■■■ 40.3
LARP4Q71RC2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.226e-10■■■■■ 40.3
LARP4Q71RC2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-10■■■■■ 40.3
LARP4Q71RC2 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 216.66■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 40.2
LARP4Q71RC2 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 312.47□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 40.2
LARP4Q71RC2 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 210.44□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 40.2
LARP4Q71RC2 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 38.63□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 40.2
LARP4Q71RC2 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 46.84□□□□□ -1.319e-7■■■■■ 40.2
LARP4Q71RC2 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 40.1
LARP4Q71RC2 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 LRPPRC-204ENST00000419884 888 ntTSL 55.18□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 LRPPRC-206ENST00000463456 3549 ntTSL 24.8□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 MRPS11-207ENST00000559323 2002 ntTSL 213.1□□□□□ -0.316e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 MRPS11-209ENST00000560708 1060 ntTSL 212.48□□□□□ -0.416e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.516e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 MRPS11-204ENST00000558406 918 ntTSL 211.28□□□□□ -0.66e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 MRPS11-201ENST00000325844 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.896e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 MRPS11-205ENST00000558548 745 ntTSL 38.93□□□□□ -0.986e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 RTN2-214ENST00000593187 299 ntTSL 27.81□□□□□ -1.166e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 MRPS11-211ENST00000561262 726 ntTSL 27.4□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 39.6
LARP4Q71RC2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 39.4
LARP4Q71RC2 GMDS-AS1-204ENST00000525811 539 ntTSL 27.96□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 39.4
LARP4Q71RC2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 38.8
LARP4Q71RC2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 38.8
LARP4Q71RC2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 38.8
LARP4Q71RC2 HSD17B10-204ENST00000477706 556 ntTSL 39.38□□□□□ -0.912e-10■■■■■ 38.8
LARP4Q71RC2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 211.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 510.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 210.31□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 27.77□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 27.54□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 38.7
LARP4Q71RC2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.521e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 QDPR-205ENST00000507439 1374 ntTSL 223.28■■□□□ 1.321e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.091e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.081e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.071e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.91e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MRPL23-206ENST00000429295 805 ntTSL 520■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MRPL23-207ENST00000462288 659 ntTSL 319.5■□□□□ 0.711e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TIMP1-204ENST00000445623 595 ntTSL 212.44□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 QDPR-203ENST00000501943 803 ntTSL 210.18□□□□□ -0.781e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.564e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 518.35■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 517.83■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-217ENST00000562750 506 ntTSL 317.68■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 517.13■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-207ENST00000611624 1799 ntTSL 514.85□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-204ENST00000375934 1263 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.184e-12■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-202ENST00000375921 2760 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-206ENST00000537116 2496 ntTSL 212.37□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 38.4
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 422.3 ms