Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.911e-19■■■■■ 100.5
LARP4Q71RC2 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.536e-22■■■■■ 93.1
LARP4Q71RC2 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.626e-22■■■■■ 93.1
LARP4Q71RC2 MT1G-201ENST00000379811 405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.846e-22■■■■■ 93.1
LARP4Q71RC2 MT1G-202ENST00000444837 406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.156e-22■■■■■ 93.1
LARP4Q71RC2 COX5B-204ENST00000494306 738 ntTSL 211.02□□□□□ -0.651e-30■■■■■ 90.3
LARP4Q71RC2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.939e-11■■■■■ 79.2
LARP4Q71RC2 AL928654.4-205ENST00000550554 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.89□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 79
LARP4Q71RC2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 79
LARP4Q71RC2 AL928654.4-203ENST00000553228 337 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.43□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 79
LARP4Q71RC2 AL928654.4-204ENST00000547184 460 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.54□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 79
LARP4Q71RC2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.75e-10■■■■■ 76.2
LARP4Q71RC2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.615e-10■■■■■ 76.2
LARP4Q71RC2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.525e-10■■■■■ 76.2
LARP4Q71RC2 AL928654.4-202ENST00000547940 435 ntTSL 516.71■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 74.4
LARP4Q71RC2 CRIP1-205ENST00000461556 638 ntTSL 215.72■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 72
LARP4Q71RC2 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-62■■■■■ 67.7
LARP4Q71RC2 ANAPC11-209ENST00000573956 2136 nt18.68■□□□□ 0.584e-18■■■■■ 66.3
LARP4Q71RC2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.599e-8■■■■■ 65.8
LARP4Q71RC2 CRIP1-206ENST00000496700 2241 ntTSL 223.02■■□□□ 1.289e-8■■■■■ 65.8
LARP4Q71RC2 CRIP1-204ENST00000460900 1443 ntTSL 220.95■□□□□ 0.949e-8■■■■■ 65.8
LARP4Q71RC2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.049e-8■■■■■ 65.8
LARP4Q71RC2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.129e-8■■■■■ 65.8
LARP4Q71RC2 AL928654.4-201ENST00000477724 678 ntAPPRIS P5 TSL 412.98□□□□□ -0.339e-8■■■■■ 65.8
LARP4Q71RC2 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.414e-17■■■■■ 63.9
LARP4Q71RC2 NDUFB10-205ENST00000570172 495 ntTSL 310.22□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 61.8
LARP4Q71RC2 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.992e-22■■■■■ 60.6
LARP4Q71RC2 WDR82-203ENST00000469000 587 ntTSL 514.75□□□□□ -0.051e-13■■■■■ 60.1
LARP4Q71RC2 WDR82-202ENST00000463624 574 ntTSL 412.35□□□□□ -0.431e-13■■■■■ 60.1
LARP4Q71RC2 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-13■■■■■ 60.1
LARP4Q71RC2 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.061e-13■■■■■ 60.1
LARP4Q71RC2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 59.9
LARP4Q71RC2 LRRC27-209ENST00000475747 2660 ntTSL 216.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 59.9
LARP4Q71RC2 LRRC27-202ENST00000368612 1765 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 59.9
LARP4Q71RC2 LRRC27-206ENST00000462656 2302 ntTSL 210.44□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 59.9
LARP4Q71RC2 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 59.9
LARP4Q71RC2 LRRC27-208ENST00000472556 646 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 59.9
LARP4Q71RC2 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC8.71□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 59.1
LARP4Q71RC2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-16■■■■■ 58.8
LARP4Q71RC2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 58.5
LARP4Q71RC2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 58.5
LARP4Q71RC2 COX6A1-202ENST00000549525 767 nt6.37□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 58.5
LARP4Q71RC2 COX7A2-208ENST00000509698 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.852e-11■■■■■ 58.4
LARP4Q71RC2 COX7A2-202ENST00000370089 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-11■■■■■ 58.4
LARP4Q71RC2 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 58.4
LARP4Q71RC2 COX7A2-204ENST00000459637 501 ntTSL 24.5□□□□□ -1.692e-11■■■■■ 58.4
LARP4Q71RC2 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.772e-11■■■■■ 58.4
LARP4Q71RC2 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.162e-11■■■■■ 58.4
LARP4Q71RC2 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 38.17□□□□□ -1.12e-20■■■■■ 56.8
LARP4Q71RC2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 56.6
LARP4Q71RC2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 56.6
LARP4Q71RC2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 56.6
LARP4Q71RC2 NDUFB10-203ENST00000565031 958 ntTSL 214.8□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 56.6
LARP4Q71RC2 TXNDC17-207ENST00000574734 616 ntTSL 318.3■□□□□ 0.522e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-206ENST00000574429 2100 nt14.91□□□□□ -0.022e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-209ENST00000576020 391 ntTSL 210.19□□□□□ -0.782e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-205ENST00000573792 505 ntTSL 310.08□□□□□ -0.82e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-203ENST00000571029 420 ntTSL 24.6□□□□□ -1.672e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 TXNDC17-210ENST00000577146 518 ntTSL 24.56□□□□□ -1.682e-12■■■■■ 56.4
LARP4Q71RC2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.337e-11■■■■■ 56.2
LARP4Q71RC2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.117e-11■■■■■ 56.2
LARP4Q71RC2 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 514.18□□□□□ -0.147e-11■■■■■ 56.2
LARP4Q71RC2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.217e-11■■■■■ 56.2
LARP4Q71RC2 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.37e-11■■■■■ 56.2
LARP4Q71RC2 DCAF10-203ENST00000461549 816 ntTSL 26.88□□□□□ -1.317e-11■■■■■ 56.2
LARP4Q71RC2 NGRN-201ENST00000331497 2784 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.073e-15■■■■■ 55.3
LARP4Q71RC2 AC091167.3-201ENST00000561573 3838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.533e-15■■■■■ 55.3
LARP4Q71RC2 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-15■■■■■ 55.3
LARP4Q71RC2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 53.3
LARP4Q71RC2 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 53.3
LARP4Q71RC2 MT1E-203ENST00000568293 332 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 53.3
LARP4Q71RC2 AP2S1-208ENST00000600964 458 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 53.2
LARP4Q71RC2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.313e-10■■■■■ 53.2
LARP4Q71RC2 GDAP1-204ENST00000521096 806 ntTSL 310.88□□□□□ -0.673e-10■■■■■ 53.2
LARP4Q71RC2 GDAP1-203ENST00000520797 735 ntTSL 37.44□□□□□ -1.223e-10■■■■■ 53.2
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.719e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.449e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.059e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.349e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-209ENST00000565205 1084 ntTSL 1 (best)11.88□□□□□ -0.519e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-203ENST00000562125 722 ntTSL 211.31□□□□□ -0.69e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-205ENST00000563514 419 ntTSL 211.31□□□□□ -0.69e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.629e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-207ENST00000564404 915 ntTSL 311.07□□□□□ -0.649e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-202ENST00000561840 558 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.699e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.749e-15■■■■■ 53.1
LARP4Q71RC2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-20■■■■■ 52.9
LARP4Q71RC2 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 518.5■□□□□ 0.552e-20■■■■■ 52.9
LARP4Q71RC2 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-13■■■■■ 52.4
LARP4Q71RC2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.686e-13■■■■■ 51.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-204ENST00000497128 914 ntTSL 219.13■□□□□ 0.656e-13■■■■■ 51.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-203ENST00000486081 1135 ntTSL 519.1■□□□□ 0.656e-13■■■■■ 51.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.636e-13■■■■■ 51.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-209ENST00000635952 853 ntTSL 318.72■□□□□ 0.596e-13■■■■■ 51.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.56e-13■■■■■ 51.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-210ENST00000636029 740 ntTSL 517.62■□□□□ 0.416e-13■■■■■ 51.3
LARP4Q71RC2 ABHD14A-ACY1-222ENST00000637222 1048 ntTSL 517.45■□□□□ 0.386e-13■■■■■ 51.3
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 283.2 ms