Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms