Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU65

UBN2, Ubinuclein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN2Q6ZU65 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
UBN2Q6ZU65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
UBN2Q6ZU65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
UBN2Q6ZU65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
UBN2Q6ZU65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
UBN2Q6ZU65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
UBN2Q6ZU65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
UBN2Q6ZU65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
UBN2Q6ZU65 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
UBN2Q6ZU65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
UBN2Q6ZU65 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
UBN2Q6ZU65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
UBN2Q6ZU65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
UBN2Q6ZU65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBN2Q6ZU65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBN2Q6ZU65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBN2Q6ZU65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBN2Q6ZU65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBN2Q6ZU65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBN2Q6ZU65 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
UBN2Q6ZU65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
UBN2Q6ZU65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
UBN2Q6ZU65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
UBN2Q6ZU65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
UBN2Q6ZU65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBN2Q6ZU65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBN2Q6ZU65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBN2Q6ZU65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBN2Q6ZU65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBN2Q6ZU65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms