Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUFY4Q6ZNE9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RUFY4Q6ZNE9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RUFY4Q6ZNE9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RUFY4Q6ZNE9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RUFY4Q6ZNE9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RUFY4Q6ZNE9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUFY4Q6ZNE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUFY4Q6ZNE9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUFY4Q6ZNE9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUFY4Q6ZNE9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUFY4Q6ZNE9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUFY4Q6ZNE9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RUFY4Q6ZNE9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RUFY4Q6ZNE9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms