Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF111Q6ZNA4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF111Q6ZNA4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF111Q6ZNA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF111Q6ZNA4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF111Q6ZNA4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF111Q6ZNA4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF111Q6ZNA4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF111Q6ZNA4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF111Q6ZNA4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF111Q6ZNA4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF111Q6ZNA4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF111Q6ZNA4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF111Q6ZNA4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF111Q6ZNA4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.4 ms