Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPO2Q6UXX9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPO2Q6UXX9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RSPO2Q6UXX9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RSPO2Q6UXX9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPO2Q6UXX9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPO2Q6UXX9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RSPO2Q6UXX9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPO2Q6UXX9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPO2Q6UXX9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPO2Q6UXX9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RSPO2Q6UXX9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPO2Q6UXX9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RSPO2Q6UXX9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPO2Q6UXX9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPO2Q6UXX9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPO2Q6UXX9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPO2Q6UXX9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms