Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN1Q6UXK5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRN1Q6UXK5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN1Q6UXK5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRN1Q6UXK5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRN1Q6UXK5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRN1Q6UXK5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRN1Q6UXK5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRN1Q6UXK5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms