Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX71

PLXDC2, Plexin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC2Q6UX71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXDC2Q6UX71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXDC2Q6UX71 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXDC2Q6UX71 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXDC2Q6UX71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXDC2Q6UX71 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXDC2Q6UX71 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXDC2Q6UX71 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXDC2Q6UX71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXDC2Q6UX71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC2Q6UX71 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC2Q6UX71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXDC2Q6UX71 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXDC2Q6UX71 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms