Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFWD3Q6PCD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFWD3Q6PCD5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RFWD3Q6PCD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFWD3Q6PCD5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFWD3Q6PCD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFWD3Q6PCD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFWD3Q6PCD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFWD3Q6PCD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFWD3Q6PCD5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFWD3Q6PCD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFWD3Q6PCD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFWD3Q6PCD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFWD3Q6PCD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms