Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LLGL2Q6P1M3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LLGL2Q6P1M3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LLGL2Q6P1M3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LLGL2Q6P1M3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LLGL2Q6P1M3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LLGL2Q6P1M3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LLGL2Q6P1M3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LLGL2Q6P1M3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LLGL2Q6P1M3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LLGL2Q6P1M3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LLGL2Q6P1M3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LLGL2Q6P1M3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LLGL2Q6P1M3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LLGL2Q6P1M3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms