Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRGCQ6NXR0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRGCQ6NXR0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRGCQ6NXR0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRGCQ6NXR0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IRGCQ6NXR0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
IRGCQ6NXR0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRGCQ6NXR0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRGCQ6NXR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IRGCQ6NXR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IRGCQ6NXR0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRGCQ6NXR0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms