Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN10Q6JVE6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN10Q6JVE6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LCN10Q6JVE6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCN10Q6JVE6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCN10Q6JVE6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCN10Q6JVE6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LCN10Q6JVE6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LCN10Q6JVE6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN10Q6JVE6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN10Q6JVE6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN10Q6JVE6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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